根据历史数据，日本人的身高在不同历史阶段存在显著差异，其最矮时期主要集中在江户时代（1603-1867年）。以下是具体分析：

一、江户时代（1603-1867年）

男性平均身高：155-158厘米

女性平均身高：143-146厘米

历史背景：这一时期日本经济停滞、社会封闭，饮食条件差、医疗水平低，导致身高普遍低下。明治维新后，随着西方技术引入和营养改善，身高开始缓慢增长。

二、绳文时代至弥生时代（公元前12000年-公元250年）

平均身高：约158厘米

特点：身高波动较小，但整体处于较低水平，可能与当时生产力水平和生活条件相关。

三、其他相关说明

战国时期：

平均身高约157厘米，但个别贵族（如织田信长）可能因营养条件较好而略高于平均值。

二战时期：

部分史料显示平均身高约1.55-1.6米，但这一数据可能存在统计偏差，且与现代日本人的身高提升无直接关联。

四、身高变化的影响因素

自然条件：岛国资源匮乏限制了食物供应和营养摄入。

社会政策：江户时代的征兵制度（150厘米为合格标准）进一步抑制了身高增长。

近现代改善：20世纪后，通过营养改善、教育普及等措施，日本身高逐步提升至现代水平。

综上，江户时代是日本历史上身高最低的时期，男性平均身高仅155-158厘米，女性更低。这一现象是多种因素共同作用的结果，包括经济、社会、环境等限制。